ZUCCOLO, ANDREA

ZUCCOLO, ANDREA  

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Titolo Data di pubblicazione Autore(i) File
"Repetitive Sequences" 1-gen-2016 Zuccolo, Andrea
A draft genome of sweet cherry (Prunus avium L.) reveals genome-wide and local effects of domestication” 1-gen-2020 Pinosio, S.; Marroni, F.; Zuccolo, A.; Vitulo, N.; Mariette, S.; Sonnante, G.; Aravanopoulos, F. A.; Ganopoulos, I.; Palasciano, M.; Vidotto, M.; Magris, G.; Iezzoni, A.; Vendramin, G. G.; Morgante, M.
A draft physical map of a D-genome cotton species (Gossypium raimondii) 1-gen-2010 L., Lin; G. J., Pierce; J. E., Bowers; J. C., Estill; R. O., Compton; L. K., Rainville; C., Kim; C., Lemke; J., Rong; H., Tang; X., Wang; M., Braidotti; A. H., Chen; K., Chicola; K., Collura; E., Epps; W., Golser; C., Grover; J., Ingles; S., Karunakaran; D., Kudrna; J., Olive; N., Tabassum; E., Um; M., Wissotski; Y., Yu; Zuccolo, Andrea; M. U., Rahman; D. G., Peterson; R. A., Wing; J. F., Wendel; A. H., Paterson
A high-performance computational workflow to accelerate GATK SNP detection across a 25-genome dataset 1-gen-2024 Zhou, Y.; Kathiresan, N.; Yu, Z.; Rivera, L. F.; Yang, Y.; Thimma, M.; Manickam, K.; Chebotarov, D.; Mauleon, R.; Chougule, K.; Wei, S.; Gao, T.; Green, C. D.; Zuccolo, A.; Xie, W.; Ware, D.; Zhang, J.; Mcnally, K. L.; Wing, R. A.
A physical map for the Amborella trichopoda genome sheds light on the evolution of angiosperm genome structure 1-gen-2011 Zuccolo, Andrea; J. E., Bowers; J. C., Estill; Z., Xiong; M., Luo; A., Sebastian; J. L., Goicoechea; K., Collura; Y., Yu; Y., Jiao; J., Duarte; H., Tang; S., Ayyampalayam; S., Rounsley; D., Kudma; A. H., Paterson; J. C., Pires; A., Chanderbali; D. E., Soltis; S., Chamala; B., Barbazuk; P. S., Soltis; V. A., Albert; H., Ma; D., Mandoli; J., Banks; J. E., Carlson; J., Tomkins; C. W., Depamphilis; R. A., Wing; J., Lebens Mack
A physical, genetic and functional sequence assembly of the barley genome 1-gen-2012 K., Mayer; R., Waugh; P., Langridge; T., Close; R., Wise; A., Graner; T., Matsumoto; K., Sato; A., Schulman; G., Muehlbauer; N., Stein; R., Ariyadasa; D., Schulte; N., Poursarebani; R., Zhou; B., Steuernagel; M., Mascher; U., Scholz; B., Shi; K., Madishetty; J., Svensson; P., Bhat; M., Moscou; J., Resnik; P., Hedley; H., Liu; J., Morris; Z., Frenkel; A., Korol; H., Bergès; S., Taudien; M., Felder; M., Groth; M., Platzer; A., Himmelbach; S., Lonardi; D., Duma; M., Alpert; F., Cordero; M., Beccuti; G., Ciardo; Y., Ma; F., Cattonaro; S., Scalabrin; S., Radovic; R., Wing; T., Nussbaumer; H., Gundlach; M., Martis; J., Poland; C., Moisy; J., Tanskanen; Zuccolo, Andrea; V., Vendramin; M., Morgante; M., Pfeifer; M., Spannagl; J., Russell; A., Druka; D., Marshall; D., Swarbreck; D., Sampath; S., Ayling; M., Febrer; M., Caccamo; T., Tanaka; S., Wannamaker; T., Schmutzer; M., Bayer; J., Brown; G., Fincher
A platinum standard pan-genome resource that represents the population structure of Asian rice 1-gen-2020 Zhou, Y.; Chebotarov, D.; Kudrna, D.; Llaca, V.; Lee, S.; Rajasekar, S.; Mohammed, N.; Al-Bader, N.; Sobel-Sorenson, C.; Parakkal, P.; Arbelaez, L. J.; Franco, N.; Alexandrov, N.; Sackville Hamilton, N. R.; Leung, H.; Mauleon, R.; Lorieux, M.; Zuccolo, A.; Mcnally, K.; Zhang, J.; Wing, R. A.
A route to de novo domestication of wild allotetraploid rice 1-gen-2021 Yu, Hong; Lin, Tao; Meng, Xiangbing; Du, Huilong; Zhang, Jingkun; Liu, Guifu; Chen, Mingjiang; Jing, Yanhui; Kou, Liquan; Li, Xiuxiu; Gao, Qiang; Liang, Yan; Liu, Xiangdong; Fan, Zhilan; Liang, Yuntao; Cheng, Zhukuan; Chen, Mingsheng; Tian, Zhixi; Wang, Yonghong; Chu, Chengcai; Zuo, Jianru; Wan, Jianmin; Qian, Qian; Han, Bin; Zuccolo, Andrea; Wing, Rod A.; Gao, Caixia; Liang, Chengzhi; Li, Jiayang
Analysis of transposons and repeat composition of the sunflower (Helianthus annuus L.) genome 1-gen-2010 A., Cavallini; L., Natali; Zuccolo, Andrea; T., Giordani; I., Jurman; V., Ferrillo; N., Vitacolonna; V., Sarri; F., Cattonaro; M., Ceccarelli; P. G., Cionini; M., Morgante
Assessing the Extent of Substitution Rate Variation of Retrotransposon Long Terminal Repeat Sequences in Oryza sativa and Oryza glaberrima 1-gen-2010 Zuccolo, Andrea; A., Sebastian; Y., Yu; S., Jackson; S., Rounsley; D., Billheimer; R. A., Wing
BAC-end Sequence Analysis and a Draft Physical Map of the Common Bean (Phaseolus vulgaris L.) Genome Status 1-gen-2008 J. A., Schlueter; J. L., Goicoechea; K., Collura; N., Gill; J., Lin; Y., Yu; D., Kudrna; Zuccolo, Andrea; C. E., Vallejos; M., Muñoz Torres; M. W., Blair; J., Tohme; J., Tomkins; P., Mcclean; R. A., Wing; S. A., Jackson
Characterization and chromosomal organization of satellite DNA sequences in Picea abies 1-gen-2008 Sarri, V; Minelli, S; Panara, F; Morgante, M; Jurman, I; Zuccolo, Andrea; Cionini, Pg
Characterization of the chromosome complement of Helianthus annuus by in situ hybridization of a tandemly repeated DNA sequence 1-gen-2007 M., Ceccarelli; V., Sarri; L., Natali; T., Giordani; A., Cavallini; Zuccolo, Andrea; I., Jurman; M., Morgante; P. G., Cionini
Comparative in silico analysis of EST-SSRs in angiosperm and gymnosperm tree genera 1-gen-2014 S., Ranade; Y. C., Lin; Zuccolo, Andrea; Y., Van de Peer Y; M., García Gil
Construction of a Nurse Shark (Ginglymostoma cirratum) Bacterial Artificial Chromosome (BAC) Library and a Preliminary Genome Survey 1-gen-2006 M., Luo; H., Kim; D., Kudrna; N. B., Sisneros; S., Lee; C., Mueller; K., Collura; Zuccolo, Andrea; B., Buckingham; S. M., Grim; K., Yanagiya; H., Inoko; T., Shiina; M. F., Flajnik; R. A. Wing R., A.; Y., Ohta
DNA transposon activity is associated with increased mutation rates in genes of rice and other grasses 1-gen-2016 Wicker, Thomas; Yu, Yeisoo; Haberer, Georg; Mayer, Klaus; Marri, Pradeep; Rounsley, Steve; Chen, Mingsheng; Zuccolo, Andrea; Panaud, Olivier; Wing, Rod; Roffler, Stefan
Dynamic Evolution of Oryza Genomes Revealed by Comparative Genomic Analysis of a Genus-wide Vertical Dataset 1-gen-2008 S. S., Ammiraju; F., Lu; A., Sanyal; Y., Yu; X., Song; N., Jiang; A. C., Pontaroli; T., Rambo; J., Currie; K., Kollura; J., Talag; C., Fan; J. L., Goicoechea; Zuccolo, Andrea; J. L., Bennetzen; M., Chen; S., Jackson; R. A., Wing
Epigenetic patterns within the haplotype phased fig (Ficus carica L.) genome 1-gen-2019 Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Vangelisti, A.; Bosi, E.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; Hassani‐pak, K.; Zambrano, L. S.; Cavallini, A.; Natali, L.
Evolution of gene structure in the conifer Picea glauca: a comparative analysis of the impact of intron size 1-gen-2014 J., Stival Sena; I., Giguère; B., Boyle; P., Rigault; I., Birol; Zuccolo, Andrea; K., Ritland; C., Ritland; J., Bohlmann; S., Jones; J., Bousquet; J., Mackay
Evolutionary dynamics of an ancient retrotransposon family provides insights into evolution of genome size in the genus Oryza 1-gen-2007 S., Jetty; Zuccolo, Andrea; Y., Yu; X., Song; B., Piegu; F., Chevalier; J., Walling; J., Ma; J., Talag; D., Brar; P., Sanmiguel; N., Jiang; S., Jackson; O., Panaud; R., Wing