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A draft physical map of a D-genome cotton species (Gossypium raimondii) 1-gen-2010 L., Lin; G. J., Pierce; J. E., Bowers; J. C., Estill; R. O., Compton; L. K., Rainville; C., Kim; C., Lemke; J., Rong; H., Tang; X., Wang; M., Braidotti; A. H., Chen; K., Chicola; K., Collura; E., Epps; W., Golser; C., Grover; J., Ingles; S., Karunakaran; D., Kudrna; J., Olive; N., Tabassum; E., Um; M., Wissotski; Y., Yu; Zuccolo, Andrea; M. U., Rahman; D. G., Peterson; R. A., Wing; J. F., Wendel; A. H., Paterson
Rice structural variation: a comparative analysis of structural variation between rice and three of its closest relatives in the genus Oryza 1-gen-2010 B., Hurwitz; D., Kudrna; Y., Yu; A., Sebastian; Zuccolo, Andrea; S., Jackson; D., Ware; R., Wing; S., Lincoln
A physical map for the Amborella trichopoda genome sheds light on the evolution of angiosperm genome structure 1-gen-2011 Zuccolo, Andrea; J. E., Bowers; J. C., Estill; Z., Xiong; M., Luo; A., Sebastian; J. L., Goicoechea; K., Collura; Y., Yu; Y., Jiao; J., Duarte; H., Tang; S., Ayyampalayam; S., Rounsley; D., Kudma; A. H., Paterson; J. C., Pires; A., Chanderbali; D. E., Soltis; S., Chamala; B., Barbazuk; P. S., Soltis; V. A., Albert; H., Ma; D., Mandoli; J., Banks; J. E., Carlson; J., Tomkins; C. W., Depamphilis; R. A., Wing; J., Lebens Mack
The Complete Genome Sequence of Campylobacter jejuni Strain S3 1-gen-2011 K., Cooper; M., Cooper; Zuccolo, Andrea; B., Law; L., Joens
Re-sequencing of a virulent strain of Campylobacter jejuni NCTC11168 reveals potential virulence factors. 1-gen-2012 K., Cooper; M., Cooper; Zuccolo, Andrea; L., Joens
A physical, genetic and functional sequence assembly of the barley genome 1-gen-2012 K., Mayer; R., Waugh; P., Langridge; T., Close; R., Wise; A., Graner; T., Matsumoto; K., Sato; A., Schulman; G., Muehlbauer; N., Stein; R., Ariyadasa; D., Schulte; N., Poursarebani; R., Zhou; B., Steuernagel; M., Mascher; U., Scholz; B., Shi; K., Madishetty; J., Svensson; P., Bhat; M., Moscou; J., Resnik; P., Hedley; H., Liu; J., Morris; Z., Frenkel; A., Korol; H., Bergès; S., Taudien; M., Felder; M., Groth; M., Platzer; A., Himmelbach; S., Lonardi; D., Duma; M., Alpert; F., Cordero; M., Beccuti; G., Ciardo; Y., Ma; F., Cattonaro; S., Scalabrin; S., Radovic; R., Wing; T., Nussbaumer; H., Gundlach; M., Martis; J., Poland; C., Moisy; J., Tanskanen; Zuccolo, Andrea; V., Vendramin; M., Morgante; M., Pfeifer; M., Spannagl; J., Russell; A., Druka; D., Marshall; D., Swarbreck; D., Sampath; S., Ayling; M., Febrer; M., Caccamo; T., Tanaka; S., Wannamaker; T., Schmutzer; M., Bayer; J., Brown; G., Fincher
The Norway spruce genome sequence and conifer genome evolution 1-gen-2013 B., Nystedt; N., Street; A., Wetterbom; Zuccolo, Andrea; Y., Lin; D., Scofield; F., Vezzi; N., Delhomme; S., Giacomello; A., Alexeyenko; R., Vicedomini; K., Sahlin; E., Sherwood; M., Elfstrand; L., Gramzow; K., Holmberg; J., Hällman; O., Keech; L., Klasson; M., Koriabine; M., Kucukoglu; M., Käller; J., Luthman; F., Lysholm; T., Niittylä; A., Olson; N., Rilakovic; C., Ritland; J., Rosselló; J., Sena; T., Svensson; C., Talavera López; G., Theißen; H., Tuominen; K., Vanneste; Z., Wu; B., Zhang; P., Zerbe; L., Arvestad; R., Bhalerao; J., Bohlmann; J., Bousquet; R., Garcia Gil; T., Hvidsten; P., de Jong; J., Mackay; M., Morgante; K., Ritland; B., Sundberg; S., Lee Thompson; Y., Van de Peer; B., Andersson; O., Nilsson; P., Ingvarsson; J., Lundeberg; S., Jansson
The high-quality draft genome of peach (Prunus persica) identifies unique patterns of genetic diversity, domestication and genome evolution 1-gen-2013 I., Verde; A., Abbott; S., Scalabrin; S., Jung; S., Shu; F., Marroni; T., Zhebentyayeva; M., Dettori; J., Grimwood; F., Cattonaro; Zuccolo, Andrea; L., Rossini; J., Jenkins; E., Vendramin; L., Meisel; V., Decroocq; B., Sosinski; S., Prochnik; T., Mitros; A., Policriti; G., Cipriani; L., Dondini; S., Ficklin; D., Goodstein; P., Xuan; C., Del Fabbro; V., Aramini; D., Copetti; S., Gonzalez; D., Horner; R., Falchi; S., Lucas; E., Mica; J., Maldonado; B., Lazzari; D., Bielenberg; R., Pirona; M., Miculan; A., Barakat; R., Testolin; A., Stella; S., Tartarini; Tonutti, Pietro; P., Arús; A., Orellana; C., Wells; D., Main; G., Vizzotto; S., Silva; F., Salamini; J., Schmutz; M., Morgante; D., Rokhsar
Sequencing of diverse mandarin, pummelo and orange genomes reveals complex history of admixture during citrus domestication 1-gen-2014 G. A., Wu; S., Prochnik; J., Jenkins; J., Salse; U., Hellsten; F., Murat; X., Perrier; M., Ruiz; S., Scalabrin; J., Terol; M. A., Takita; K., Labadie; J., Poulain; A., Couloux; K., Jabbari; F., Cattonaro; C., Del Fabbro; S., Pinosio; Zuccolo, Andrea; J., Chapman; J., Grimwood; F. R., Tadeo; L. H., Estornell; J. V., Muñoz Sanz; V., Ibanez; A., Herrero Ortega; P., Aleza; J., Pérez Pérez; D., Ramón; D., Brunel; F., Luro; C., Chen; W. G., Farmerie; B., Desany; C., Kodira; M., Mohiuddin; T., Harkins; K., Fredrikson; P., Burns; A., Lomsadze; M., Borodovsky; G., Reforgiato; J., Freitas Astúa; F., Quetier; L., Navarro; M., Roose; P., Wincker; J., Schmutz; M., Morgante; M. A., Machado; M., Talon; O., Jaillon; P., Ollitrault; F., Gmitter; D., Rokhsar
Targeting environmental adaptation in the monocot model Brachypodium distachyon: a multi-faceted approach 1-gen-2014 Dell'Acqua, Matteo; Zuccolo, Andrea; M., Tuna; L., Gianfranceschi; Pe', MARIO ENRICO
Comparative in silico analysis of EST-SSRs in angiosperm and gymnosperm tree genera 1-gen-2014 S., Ranade; Y. C., Lin; Zuccolo, Andrea; Y., Van de Peer Y; M., García Gil
The genome sequence of African rice (Oryza glaberrima) and evidence for independent domestication 1-gen-2014 M., Wang; Y., Yu; G., Haberer; P., Marri; C., Fan; J. L., Goicoechea; Zuccolo, Andrea; X., Song; D., Kudrna; J., Ammiraju; R. M., Cossu; C., Maldonado; J., Chen; S., Lee; N., Sisneros; K., de Baynast; W., Golser; M., Wissotski; W., Kim; P., Sanchez; M., Ndjiondjop; K., Sanni; M., Long; J., Carney; O., Panaud; T., Wicker; C., Machado; M., Chen; K., Mayer; S., Rounsley; R., Wing
Evolution of gene structure in the conifer Picea glauca: a comparative analysis of the impact of intron size 1-gen-2014 J., Stival Sena; I., Giguère; B., Boyle; P., Rigault; I., Birol; Zuccolo, Andrea; K., Ritland; C., Ritland; J., Bohlmann; S., Jones; J., Bousquet; J., Mackay
The Ty1-copia LTR retroelement family PARTC is highly conserved in conifers over 200MY of evolution 1-gen-2015 Zuccolo, Andrea; Scofield, Douglas G; De Paoli, Emanuele; Morgante, Michele
RiTE database: a resource database for genus-wide rice genomics and evolutionary biology 1-gen-2015 D. Copetti,  . J. Zhang; Baidouri,  . M. El; Gao,  . d.; Wang,  . j.; Barghini,  . e.; Cossu, ROSA MARIA; Angelova,  . a.; Maldonado,  . c.; Roffler,  . s.; Ohyanagi, H.; Wicker,  . t.;  c, ; Fan, ; Zuccolo, Andrea; Chen,  . m.; Oliveira,  . A. Costa de; Han,  . b.; Henry,  . r.; Hsing,  . y.; Kurata,  . n.; Wang,  . w.; Jackson,  . s.; Panaud,  . o.
"Repetitive Sequences" 1-gen-2016 Zuccolo, Andrea
Identification and characterization of abundant repetitive sequences in Eragrostis tef cv. Enatite genome 1-gen-2016 Gebre, Yohannes Gedamu; Bertolini, Edoardo; Pe', MARIO ENRICO; Zuccolo, Andrea
DNA transposon activity is associated with increased mutation rates in genes of rice and other grasses 1-gen-2016 Wicker, Thomas; Yu, Yeisoo; Haberer, Georg; Mayer, Klaus; Marri, Pradeep; Rounsley, Steve; Chen, Mingsheng; Zuccolo, Andrea; Panaud, Olivier; Wing, Rod; Roffler, Stefan
Extreme hypoxic conditions induce selective molecular responses and metabolic reset in detached apple fruit 1-gen-2016 Cukrov, Dubravka; Zermiani, Monica; Brizzolara, Stefano; Cestaro, Alessandro; Licausi, Francesco; Luchinat, Claudio; Santucci, Claudio; Tenori, Leonardo; VAN VEEN, Hans; Zuccolo, Andrea; Ruperti, Benedetto; Tonutti, Pietro
LTR retrotransposons show low levels of unequal recombination and high rates of intraelement gene conversion in large plant genomes. 1-gen-2017 Cossu, Rosa Maria; Casola, Claudio; Giacomello, Stefania; Vidalis, Amaryllis; Scofield, Douglas; Zuccolo, Andrea
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